En esa primera mitad del 2018 llegaron a la final del torneo de Copa MX, siendo derrotados por Club Necaxa. Para el Apertura 2018 el Toluca contrató a William da Silva, Adolfo Domínguez, Amaury Escoto, Richard Ruiz, Luis Ángel Mendoza, Héctor Acosta, Fernando Tobio y el retorno de Enrique Triverio, durante el torneo estuvo todas la 17 jornadas en puestos de Liguilla, para culminar 7º. En los cuartos de final se enfrentaron al América, quien a la postre sería campeón siendo eliminados por un global de 5-4. Al torneo siguiente se mantiene a Cristante, en sus dos primeros partidos el equipo se mantiene como Superlíder, pero después hubo una racha de 6 partidos sin ganar, 5 derrotas y un empate.